六条壬晴，除了对周围的事物漠不关心这一特点外，只是一个平凡不过的学生。可是，他的体内却隐藏著忍者世界──隐之世的最强秘术「森罗万象」。因此，在现代仍然拥有相当实力的伊贺忍派「灰狼眾」誓要夺得壬晴。另一方面，壬晴就读的万天中学的英文老师云平‧帷‧狄兰达鲁，以及他的朋友虹一原来是保护壬晴的忍者。被捲进伊贺及风魔两派的战争旋涡之中的壬晴想恢复过往的生活──就只有成为隐之王！不得不前往隐之世界的少年…展开战争！

森罗万象：在忍者的世界“隐之世”中被称为能支配万物的秘术。没有什么人能知道它实际的形态。虽然有很多写着那个秘术的卷轴，但其实所有的数据都和壬晴的身体相溶合了。

五之里：指的是风魔、伊贺、甲贺、户隐、万天。在山阳的万天是最新从伊贺分出来的派系。五之里之间，有着一个互相不可侵犯的不成文的条例。但随着“森罗万象”的复活，各自都有着自己的考虑与立场，所以围绕着解开“森罗万象”之谜而开始了禁术之争。

灰狼忍：伊贺忍中的急进派。这一派由在外的身份是政治评论家的服部柊十郎带领。他们为了得到“森罗万象”究竟会使出些什么样的手段来，现在暂时还不明了。派中拥有使用禁术的宵风，并得到了五之里中其它里所保胡的禁术，开始实行将“森罗万象”从壬晴身体中硬行剥离的行动。